Euskadi tenía asignados 179,1 millones de los fondos de cohesión europeos para el programa operativo FEDER 2014-2020. Entre los proyectos que se iban a sufragar estaban varios relacionados con la lucha contra el cambio climático o las nuevas tecnologías y ... la innovación. Pero Euskadi y Asturias fueron las primeras comunidades autónomas que solicitaron la reorientación de los fondos para reforzar las capacidades de respuesta del sector sanitario a la pandemia. Con el permiso de la Comisión Europea, Euskadi destinó 94 millones a la compra de material sanitario, a reforzar la plantilla, reordenar espacios hospitalarios y gestionar medicamentos, pruebas y aplicaciones telemáticas para monitorización, seguimiento y análisis de datos. Es decir, la ejecución de parte de las actuaciones programadas inicialmente fue efectada para aliviar la carga de los presupuestos de la Administración.
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Para poder modificar el destino de los fondos, el País Vasco realizó una estimación del importe que había destinado a la lucha contra la pandemia entre marzo y mayo y lo que suponía que iba a tener que gastar en la segunda oleada, ya que presentó la petición en julio. Según la documentación que el Gobierno vasco envió a la Comisión, Euskadi gastó 277,5 millones en la primera ola y preveía gastar otros 212,8 en la segunda hasta un total de 490 millones de euros durante 2020.
En 2021 el presupuesto del Departamento de Salud será de 4.183 millones de euros, 236 más que en este 2020. Según esta planificación, Osakidetza destinó 70 millones a personal contratado en exclusiva para la crisis y otros 200 a la derivación de personal con dedicación completa para el coronavirus, además de otros 58 millones para equipos de protección individual y 10,5 para material de laboratorio. También se preveían otros 115 para sufragar estancias hospitalarias Covid, la atención en urgencias y las hospitalizaciones a domicilio. Lucas González Ojeda, portavoz de la Representación de la Comisión Europea en España, explicó también que la Comisión Europea ha trabajado en una estrategia con la que se apoyará los esfuerzos por acelerar el desarrollo y la disponibilidad de vacunas seguras y eficaces.
Actualmente, la Comisión ha celebrado seis contratos que permitirán la adquisición de hasta 2 mil millones de dosis de vacunas, cuando se haya demostrado que es segura y eficaz, con las siguientes empresas o alianzas: AstraZeneca, SanofiGSK, Johnson & Johnson, BioNTech-Pfizer, CureVac y Moderna. La vacunación comenzó a finales de diciembre tras la aprobación de la vacuna BioNtech-Pfizer. También se ha aprobado la vacuna de Moderna, con la que se ha comenzado a vacunar el 6 de enero.
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